Willkommen an Bord der U.S.S. Incursion, dem neuesten Schiff der Sternenflotte. Aber im Gegensatz zur Enterprise ist sie ein sehr unbekanntes Schiff und das ist auch gut so, denn die Incursion ist für Geheimaufträge ausgelegt. Die Crew besteht aus Spezialisten, die extra für verdeckte Operationen ausgebildet wurden. Die Sternenflotte nennt sie schlicht das “Away Team” – sie helfen immer dort, wo es wirklich brenzlig ist. Ihr schlüpft dabei in Rolle der taktischen Leitung des Teams und führt sie sicher durch die Missionen – wie in Eidos´ berühmtem Taktikspiel Commandos.

Story

Zu Beginn des Spiels wird die Incursion damit beauftragt einem befreundeten klingonischen Außenposten zu Hilfe zu eilen. Die Romulaner haben die Station aus einem bisher unbekannten Grund angegriffen. Als die Incursion eintrifft, beamen sich Captain Refelian und drei weitere Mitglieder des Away Teams zur Basis hinunter und helfen den klingonischen Sicherheitsleuten die Romulaner wieder zu vertreiben und zwei Wissenschaftler zu befreien.

Diese erste Mission ist gleichzeitig ein Tutorial für das Spiel – Ihr werdet von Lt. Cmdr. Data (bekannt aus der Serie Star Trek – Die nächste Generation, sowie den Kinofilmen VII – IX) höchstpersönlich instruiert. Nach Abschluss der Mission stellt sich heraus, dass die Romulaner in dem Außenposten nach einem kürzlich entdeckten und äußert gefährlichen Seuchenerreger gesucht haben. Zum Glück sind schon vor dem Angriff vier der Wissenschaftler zu einem Förderationsschiff geflogen, um dort vor eventuellen Angriffen sicher zu sein. Also macht sich das Away Team auf zu diesem Schiff.

Leider wird man dort nicht freundlich begrüßt, sondern gleich mit einem Phaserstrahl gejagt. Es stellt sich heraus, dass die gesamte Crew des Schiffs mit der Seuche infiziert ist und dahinter offenbar eine Verschwörung steckt, in der auch viele hochrangige Sternenflottenoffiziere stecken. Im Spielverlauf entwickelt sich die spannende Story immer weiter und das Komplott wird immer undurchsichtiger, aber allzu viel wollen wir hier nicht verraten!